어머니를 살리기 위해 연금술의 금기를 건드렸다가 몸을 잃은 엘릭 형제와, 거인의 습격으로 어머니를 잃고 복수를 다짐한 에렌 예거, 그리고 엉뚱한 5살 악동 신짱구와 떡잎마을 방범대는 거인의 위협 속에서 세상의 진실을 파헤치기 위해 하나의 운명으로 얽힙니다. 방벽 너머와 생가 지하실을 향해 여정을 이어가던 이들은, 자신들이 사는 국가가 사실 전 국민을 제물로 바쳐 신이 되려는 괴물 '아버지'와 호문쿨루스들이 설계한 거대한 연성진이자 거인 생산 구역이었다는 충격적인 진실을 맞닥뜨립니다.

​'아버지'가 세상을 짓밟는 '땅울림'과 전 인류를 제물로 삼는 '국토연성진'을 동시에 발동시켜 절망이 도래하자, 이들은 인류의 생존과 소중한 인연을 지키기 위해 최종 결전에 나섭니다. 에렌은 스스로 거대한 악역을 자처하며 증오의 굴레를 끌어안고, 에드워드는 연금술사로서의 전능한 힘(진리의 문)을 미련 없이 포기하며 동생과 세계를 구하는 선택을 합니다. 여기에 어떤 비극과 절망 앞에서도 굴하지 않는 짱구의 기상천외한 순수함과 짱구네 가족의 끈끈한 사랑이 더해지며, 마침내 수천 년간 이어져 온 증오와 오만의 연쇄가 산산조각 납니다. 결국 거인의 힘과 연금술의 오만은 세상에서 완전히 소멸하고, 거창한 위협을 이겨낸 이들은 다시 가족, 친구들과 함께 초코비를 먹으며 웃고 울 수 있는 '소중하고 평화로운 일상'으로 돌아가게 됩니다.